subroutines,
87 total:

BENERGY  1,5
CD_CORE  1,23
COMPUTE_GSFACTORS  10
COPY_INIDAT  1,24
C_SW    1,11
D2A3DIJK  ,3
D2A3DIKJ  1,3
DECOMP_WAVENUMBERS  ,1
DRYAIRM  2,6
DYNAMICS_CLEAN  ,1
DYNAMICS_INIT  2,5
DYNCONSTI  1
DYNPKG  1,9
DYNPKG_INIT  1
D_P_COUPLING  1,16
D_SPLIT  1
D_SW    1,8
FFTFAX  1,1
FILEW   1,5
FILLXY  1,2
FILLZ   ,1
FILNS   ,1
FV_OUT  1
FXPPM   2,5
FYPPM   1,2
GEOPK   2,1
GEOPK16  2,3
GET_BLOCK_BOUNDS_D  2,1
GET_BLOCK_COORD_D  9,4
GET_BLOCK_LEVELS_D  1,1
GMEAN   4,6
HUYNH   1,1
INITAL  1,34
INITCOM  2,11
INITIALIZE_PROGNOSTICS  2
KMPPM   4,1
LMPPM   2,1
LRREADIN  10,5
LRREADIN4  3,5
LRREADINI  2,5
MAP1_PPM  3,2
MAPN_PPM  1,2
PAR_VECSUM  3,1
PAR_XSUM  6,3
PFIX    4,1
PFT2D   10,3
PFT_CF  1,1
PKEZ    3,1
PMAXMIN  1,1
PMAXMIN2  7,1
PPM2M   2,6
P_D_ADJUST  1,8
P_D_COUPLING  1,11
READ_INIDAT  1,152
READ_RESTART_DYNAMICS  1,14
RFFTMLT  2,1
SCATTER_Q_FIELD_TO_BLOCK  1,3
SETRIG  1
SET_ETA  1
SHIFT_TIME_INDICES  1
SPMDBUF  ,1
SPMDINIT_DYN  1,15
SPMD_DYN_DEFAULTOPTS  2
SPMD_DYN_SETOPTS  2,3
SPMD_VARS_CLEAN  1,1
SPMD_VARS_INIT  1,2
STEEPX  1
STEEPZ  1,1
STEPON  1,44
TE_MAP  1,19
TP2C    5,2
TP2D    2,4
TPCC    1,4
TRAC2D  1,9
TRUNC   1
UPOL5   1,1
UV3S_UPDATE  1,7
VPOL5   1,1
WRITE_RESTART_DYNAMICS  1,8
WRTOUT  7,5
WRTOUTI  ,5
XMIST   2,1
XPAVG   17,1
XTP     6,5
YCC     2,1
YMIST   1,1
YTP     2,3

functions,
8 total:

DYCORE_IS  
GET_BLOCK_COL_CNT_D  4,4
GET_BLOCK_COORD_CNT_D  7
GET_BLOCK_LVL_CNT_D  2
GET_BLOCK_OWNER_D  10,2
GET_LAT_D  2,2
GET_LON_D  2,2
GET_RESOLUTION  ,1

modules,
18 total:

COMMAP  22,2
COMSPE  ,3
DP_COUPLING  1,11
DYCORE  27
DYNAMICS_VARS  13,2
DYNCONST  2,2
DYN_GRID  5,3
FILL_MODULE  1
FV_PRINTS  1,22
INIDAT  1,3
MAPZ_MODULE  1
PFT_MODULE  2
PMGRID  151
PROGNOSTICS  11,5
RESTART_DYNAMICS  3,6
SPMD_DYN  42,5
SW_CORE  1,1
TP_CORE  3,1